Ο Σύλλογος Αποφοίτων του Αμαλιείου ιδρύθηκε το 1996. Τα πρώτα ενεργά μέλη του ήταν 36 στον αριθμό και σήμερα είναι περίπου 70. Το Συμβούλιό του είναι εννεαμελές. Πρόεδρός του είναι η κα Τσαβδάρα Σωτηρία. Η έδρα του βρίσκεται στην οδό Σωκράτους 59, σε χώρο παραχωρημένο από το Αμαλίειον. Το Αμαλίειον ενισχύει και τιμά την ύπαρξη και λειτουργία του Συλλόγου, προκειμένου τα μέλη του να συνεχίζουν και μετά την ολοκλήρωση των σπουδών τους να διατηρήσουν την επαφή τους με τις συνοικοτρόφους και να αναπτύξουν ουσιαστικές σχέσεις με τα παλαιότερα μέλη, με τη Διοίκηση και τη Διεύθυνση του Οικοτροφείου. Ο Σύλλογος με τη σειρά του, όντας αναπόσπαστο κομμάτι του Αμαλιείου, είναι παρών σε όλες τις εορτές και δραστηριότητες του Οικοτροφείου.
Όποιος επιθυμεί να επικοινωνήσει με τον Σύλλογο μπορεί να καλέσει στο Γραφείο Διεύθυνσης του Οικοτροφείου, τηλ. 210 – 8020610 ή στη διεύθυνση boardingschool@amalieion.gr